More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1636 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  332  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  90.8 
 
 		 164 aa  306  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  85.89 
 
 		 164 aa  290  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  85.89 
 
 		 164 aa  290  4e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  85.89 
 
 		 164 aa  290  4e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  84.76 
 
 		 164 aa  288  2e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  84.66 
 
 		 164 aa  288  3e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  82.32 
 
 		 164 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  74.07 
 
 		 162 aa  241  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  70.99 
 
 		 172 aa  229  9e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  64.63 
 
 		 163 aa  218  3e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 		 165 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 		 165 aa  197  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  56.02 
 
 		 167 aa  184  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  55.69 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  56.79 
 
 		 160 aa  171  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  56.44 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  54.32 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 167 aa  167  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  57.86 
 
 		 160 aa  167  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  53.37 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.04 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  52.38 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  50 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 167 aa  157  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  52.53 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  51.52 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  51.25 
 
 		 167 aa  148  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  49.7 
 
 		 165 aa  145  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  48.48 
 
 		 160 aa  142  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  49.38 
 
 		 161 aa  142  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  48.48 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  47.9 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  48.15 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  45.68 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  47.56 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  47.56 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  47.56 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  44.81 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  41.36 
 
 		 159 aa  104  4e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  37.72 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  39.05 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  36.42 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  37.42 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.47 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  37.75 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  35.19 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  36.62 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  40.71 
 
 		 153 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  33.74 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  38.19 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  34.59 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  34.59 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  35.77 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  34.46 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  34.19 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  73.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0589  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00434692  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  36.94 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  34.67 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  32.05 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  37.34 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  36.49 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  39.53 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  32.17 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  37.78 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>