More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0313 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 161 aa  325  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  98.76 
 
 		 161 aa  323  8.000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  98.14 
 
 		 161 aa  322  2e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  75.16 
 
 		 161 aa  252  1.0000000000000001e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  65.82 
 
 		 161 aa  225  2e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  63.35 
 
 		 162 aa  224  4e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 		 161 aa  222  1e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  63.52 
 
 		 162 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  55.35 
 
 		 167 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  52.47 
 
 		 165 aa  184  3e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 156 aa  170  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 157 aa  167  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 152 aa  160  7e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 156 aa  160  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 157 aa  160  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 168 aa  160  9e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 157 aa  157  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 156 aa  153  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  48.41 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 166 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 165 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 168 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 176 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  44.03 
 
 		 169 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 152 aa  143  9e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  47.77 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  46.5 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  46.2 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>