More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0654 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 		 162 aa  193  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0084  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 		 170 aa  181  4.0000000000000006e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.270198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  54.6 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 157 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  55.35 
 
 		 157 aa  168  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  53.12 
 
 		 157 aa  167  8e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  52.2 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  51.53 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 157 aa  157  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 152 aa  157  6e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  50.93 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  51.88 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 156 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 152 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  51.88 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  49.07 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  49.07 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  50.62 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  154  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  49.07 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  48.75 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 203 aa  152  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  48.45 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  48.45 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 157 aa  150  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  47.83 
 
 		 165 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.83 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  48.43 
 
 		 156 aa  148  4e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  46.58 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  52.5 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  45.62 
 
 		 158 aa  147  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 179 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  49.03 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  47.2 
 
 		 168 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  47.2 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 		 162 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  48.75 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  48.75 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  46.25 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  48.41 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  47.83 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>