More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH_0133 on replicon NC_007799
Organism: Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 162 aa  325  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0084  transcription elongation factor GreA  93.83 
 
 		 170 aa  287  4e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.270198  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 		 164 aa  193  9e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 152 aa  166  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  54.72 
 
 		 157 aa  165  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  55.62 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  55.62 
 
 		 156 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  55.97 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  55.62 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  55 
 
 		 203 aa  161  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  53.7 
 
 		 158 aa  160  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  55 
 
 		 157 aa  160  9e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  53.75 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  55 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  56.6 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 171 aa  157  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 168 aa  156  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  54.72 
 
 		 168 aa  156  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  55.97 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 156 aa  155  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  54.6 
 
 		 158 aa  153  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  53.7 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  52.47 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 152 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  53.7 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 158 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  52.47 
 
 		 158 aa  151  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 166 aa  150  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 160 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  51.85 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  51.85 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  50.62 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  52.5 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  51.85 
 
 		 165 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  48.15 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  51.85 
 
 		 174 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  51.85 
 
 		 179 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  48.78 
 
 		 173 aa  147  5e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  48.78 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  51.88 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  51.23 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 158 aa  146  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  47.2 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  51.23 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  48.77 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  47.83 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  49.1 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  50.62 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 163 aa  143  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  47.83 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  48.17 
 
 		 159 aa  143  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  50.62 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  48.47 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  50.62 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  50.62 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  51.22 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  50.62 
 
 		 158 aa  142  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  47.2 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  50.61 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  50.61 
 
 		 158 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  48.17 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  48.15 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  48.77 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  48.15 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  48.45 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  49.38 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  46.63 
 
 		 169 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  45.68 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>