More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1454 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  99.36 
 
 
157 aa  314  6e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  94.9 
 
 
157 aa  305  3e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  81.41 
 
 
157 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  79.62 
 
 
157 aa  262  2e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  80.13 
 
 
158 aa  258  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  80.13 
 
 
158 aa  257  6e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  79.49 
 
 
158 aa  256  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  78.85 
 
 
158 aa  254  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  74.36 
 
 
157 aa  246  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  72.44 
 
 
158 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 
158 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 
179 aa  236  1e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  70.51 
 
 
168 aa  231  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 
160 aa  228  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 
160 aa  226  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 
160 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  71.52 
 
 
152 aa  222  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  66.03 
 
 
158 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  64.2 
 
 
174 aa  217  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  68.21 
 
 
152 aa  216  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  63.58 
 
 
165 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 
158 aa  214  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 
158 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  66.03 
 
 
158 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 
158 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  62.82 
 
 
157 aa  208  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  63.69 
 
 
157 aa  206  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  64.94 
 
 
157 aa  205  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 
157 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 
156 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 
156 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  62.18 
 
 
157 aa  199  3e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  61.15 
 
 
156 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  61.15 
 
 
156 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 
171 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  59.24 
 
 
156 aa  191  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  58.28 
 
 
152 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 
156 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
166 aa  188  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
166 aa  187  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 
158 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 
158 aa  184  6e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 
158 aa  184  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 
154 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  58.86 
 
 
158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  56.49 
 
 
158 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 
158 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 
158 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  57.32 
 
 
158 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  57.32 
 
 
158 aa  177  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
158 aa  176  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 
158 aa  176  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 
158 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 
158 aa  176  3e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  56.69 
 
 
158 aa  174  9.999999999999999e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
158 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  52.53 
 
 
158 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  172  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 
159 aa  171  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  58.23 
 
 
158 aa  171  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  171  5.999999999999999e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 
158 aa  171  9e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 
158 aa  170  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
160 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
160 aa  170  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  57.86 
 
 
157 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  170  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
158 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  57.5 
 
 
176 aa  169  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 
158 aa  169  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  54.43 
 
 
158 aa  168  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  56.6 
 
 
158 aa  168  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  57.23 
 
 
157 aa  168  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 
158 aa  168  6e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 
158 aa  167  7e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 
158 aa  167  8e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 
158 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 
158 aa  167  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 
158 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 
158 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 
159 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 
158 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>