More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3400 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  93.67 
 
 		 158 aa  297  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  87.34 
 
 		 179 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  84.62 
 
 		 160 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  84.62 
 
 		 160 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  84.62 
 
 		 160 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  78.21 
 
 		 157 aa  246  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  74.36 
 
 		 157 aa  240  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  71.97 
 
 		 157 aa  239  9e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  73.25 
 
 		 157 aa  239  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  78.81 
 
 		 152 aa  239  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 		 203 aa  238  2.9999999999999997e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  71.15 
 
 		 158 aa  234  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  69.87 
 
 		 158 aa  233  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  72.44 
 
 		 168 aa  233  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  69.23 
 
 		 158 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  69.23 
 
 		 158 aa  227  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  67.52 
 
 		 157 aa  224  4e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  74.17 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  67.31 
 
 		 158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  67.95 
 
 		 158 aa  217  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 		 165 aa  216  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  67.31 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  66.03 
 
 		 174 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  64.33 
 
 		 156 aa  204  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  66.03 
 
 		 171 aa  203  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 		 156 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  64.1 
 
 		 156 aa  200  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 		 157 aa  197  3e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  63.69 
 
 		 156 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 157 aa  191  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  57.79 
 
 		 157 aa  188  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  60.51 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  57.62 
 
 		 152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 168 aa  177  7e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 166 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 166 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 166 aa  174  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  57.79 
 
 		 158 aa  174  4e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  57.59 
 
 		 158 aa  174  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 158 aa  172  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  55.7 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  57.32 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 160 aa  169  1e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  55.19 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 		 154 aa  168  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  167  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 		 158 aa  167  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 159 aa  167  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  53.8 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  55.7 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  53.5 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  54.9 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 172 aa  164  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 168 aa  164  5.9999999999999996e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 159 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 169 aa  163  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  52.26 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3073  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0163  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000328888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>