More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0426 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  308  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  80.13 
 
 		 156 aa  260  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  79.49 
 
 		 156 aa  259  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  79.49 
 
 		 156 aa  259  8e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  77.42 
 
 		 171 aa  255  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  72.44 
 
 		 156 aa  238  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  70.32 
 
 		 156 aa  230  4.0000000000000004e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  65.38 
 
 		 157 aa  207  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  64.33 
 
 		 158 aa  204  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  63.46 
 
 		 168 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  65.38 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  63.69 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 157 aa  202  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 157 aa  201  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 		 158 aa  201  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 		 157 aa  200  6e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 		 203 aa  200  7e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  63.46 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 		 157 aa  199  9.999999999999999e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  63.46 
 
 		 157 aa  198  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  64.9 
 
 		 152 aa  197  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  62.18 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 158 aa  196  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  64.24 
 
 		 152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 		 160 aa  194  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  62.82 
 
 		 158 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 174 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  62.18 
 
 		 179 aa  193  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  62.25 
 
 		 152 aa  192  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 		 158 aa  191  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  59.62 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  59.62 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  59.74 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 154 aa  184  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  61.39 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  58.86 
 
 		 158 aa  183  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  183  9e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  55.7 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 166 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 166 aa  180  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 159 aa  179  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  59.09 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  58.86 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  57.96 
 
 		 158 aa  179  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 159 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  56.96 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  55.06 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 158 aa  177  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 158 aa  176  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 168 aa  176  9e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  57.42 
 
 		 180 aa  175  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 		 159 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>