More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2715 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
158 aa  317  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  98.73 
 
 
158 aa  315  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  93.67 
 
 
158 aa  298  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  89.24 
 
 
158 aa  287  5.0000000000000004e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  83.44 
 
 
157 aa  265  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  80.77 
 
 
157 aa  260  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  80.77 
 
 
157 aa  259  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  80.13 
 
 
203 aa  258  2e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  77.56 
 
 
157 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  73.08 
 
 
157 aa  240  7e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  71.97 
 
 
160 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 
160 aa  237  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 
160 aa  237  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  73.25 
 
 
179 aa  237  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  71.15 
 
 
158 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 
174 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 
165 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  69.23 
 
 
158 aa  228  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  69.43 
 
 
158 aa  227  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 
158 aa  227  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 
158 aa  226  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 
158 aa  225  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  70.06 
 
 
158 aa  225  2e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 
168 aa  223  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  70.2 
 
 
152 aa  223  6e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  69.74 
 
 
152 aa  219  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  64.97 
 
 
157 aa  217  5e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  66.88 
 
 
157 aa  214  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  67.31 
 
 
157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  62.42 
 
 
157 aa  203  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  60.51 
 
 
157 aa  198  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  62.5 
 
 
152 aa  197  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  62.82 
 
 
156 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 
171 aa  192  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 
156 aa  193  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 
156 aa  191  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 
166 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 
156 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 
166 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 
166 aa  189  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 
156 aa  189  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
168 aa  189  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 
156 aa  188  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  59.21 
 
 
154 aa  178  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 
158 aa  177  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 
158 aa  174  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 
159 aa  174  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 
158 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 
158 aa  170  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 
159 aa  169  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 
158 aa  168  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 
158 aa  169  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  169  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 
158 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  57.52 
 
 
158 aa  168  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 
158 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  167  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  167  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  59.75 
 
 
158 aa  167  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  59.75 
 
 
158 aa  167  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
158 aa  167  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 
158 aa  167  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  57.89 
 
 
158 aa  166  8e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
158 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  165  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  56.13 
 
 
158 aa  165  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 
158 aa  165  2e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 
157 aa  164  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 
158 aa  164  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 
158 aa  164  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  164  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 
160 aa  163  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 
160 aa  163  9e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 
169 aa  161  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 
158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 
157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 
158 aa  160  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 
159 aa  160  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  55.84 
 
 
158 aa  159  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  55.84 
 
 
158 aa  159  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
158 aa  158  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
158 aa  158  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
158 aa  158  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 
159 aa  159  2e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  50.96 
 
 
158 aa  159  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
158 aa  158  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
158 aa  158  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
158 aa  158  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>