More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1023 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  100 
 
 
160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  98.75 
 
 
160 aa  314  4e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  98.75 
 
 
160 aa  314  4e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  88.05 
 
 
179 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  84.62 
 
 
158 aa  272  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  81.41 
 
 
158 aa  266  7e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  75.8 
 
 
158 aa  251  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  71.97 
 
 
158 aa  241  3e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  71.97 
 
 
158 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 
158 aa  237  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  73.08 
 
 
157 aa  233  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  72.85 
 
 
152 aa  228  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  69.23 
 
 
157 aa  228  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 
203 aa  228  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 
157 aa  227  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 
168 aa  226  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  69.23 
 
 
157 aa  224  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  69.23 
 
 
158 aa  224  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 
158 aa  222  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  65.38 
 
 
158 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  71.05 
 
 
152 aa  219  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  66.03 
 
 
174 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 
157 aa  219  1.9999999999999999e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  66.03 
 
 
165 aa  218  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  65.38 
 
 
158 aa  215  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  66.03 
 
 
158 aa  215  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  64.1 
 
 
157 aa  206  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  61.15 
 
 
157 aa  200  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 
171 aa  197  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 
156 aa  196  7.999999999999999e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 
156 aa  194  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  59.74 
 
 
157 aa  194  6e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  59.24 
 
 
157 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 
156 aa  191  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 
156 aa  190  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 
156 aa  190  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 
156 aa  186  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  56.58 
 
 
152 aa  183  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 
157 aa  183  8e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 
158 aa  174  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 
168 aa  173  9e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  55.56 
 
 
158 aa  171  5e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 
166 aa  170  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 
166 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 
166 aa  170  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 
158 aa  167  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  56.58 
 
 
154 aa  167  4e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 
158 aa  167  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 
158 aa  167  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  57.14 
 
 
158 aa  167  7e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  57.14 
 
 
158 aa  167  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 
158 aa  166  9e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  56.49 
 
 
158 aa  165  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 
158 aa  164  6.9999999999999995e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 
169 aa  162  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  55.19 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  52.23 
 
 
158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
158 aa  161  3e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 
158 aa  161  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  55.84 
 
 
158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 
159 aa  160  6e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
160 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 
160 aa  160  7e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  51.95 
 
 
173 aa  160  8.000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 
158 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
158 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 
168 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 
158 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  52.23 
 
 
158 aa  159  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 
159 aa  158  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 
158 aa  158  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
157 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  52.9 
 
 
158 aa  158  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 
158 aa  158  3e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 
158 aa  158  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 
159 aa  158  3e-38  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 
158 aa  158  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 
157 aa  157  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 
158 aa  157  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
158 aa  157  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 
158 aa  156  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 
159 aa  156  9e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 
158 aa  156  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 
158 aa  156  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 
158 aa  155  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 
158 aa  155  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 
158 aa  155  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 
158 aa  155  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 
173 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 
158 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 
158 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 
158 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 
158 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 
158 aa  153  8e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 
158 aa  153  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 
159 aa  153  9e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 
158 aa  153  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 
158 aa  152  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 
158 aa  153  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>