More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1611 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  318  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  69.43 
 
 		 158 aa  231  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 		 158 aa  229  8.000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  69.62 
 
 		 158 aa  229  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  68.79 
 
 		 158 aa  228  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  70.44 
 
 		 159 aa  228  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  55.26 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  54.3 
 
 		 152 aa  174  4e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  173  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  56.21 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 168 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 165 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 176 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  52.98 
 
 		 152 aa  169  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 157 aa  169  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 157 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 171 aa  168  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  167  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  52.87 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  167  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  166  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 		 172 aa  166  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  53.64 
 
 		 152 aa  165  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 157 aa  164  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  51.28 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 		 157 aa  164  5e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  51.95 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 158 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  49.06 
 
 		 173 aa  163  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  48.72 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 203 aa  160  5.0000000000000005e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  51.85 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 160 aa  160  6e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  54.25 
 
 		 179 aa  160  7e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  53.7 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>