More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00085 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 154 aa  306  5.9999999999999995e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  81.82 
 
 		 158 aa  261  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  83.01 
 
 		 158 aa  259  1e-68  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  82.35 
 
 		 158 aa  256  8e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  66.01 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  63.16 
 
 		 158 aa  204  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 158 aa  202  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 158 aa  201  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  64.05 
 
 		 158 aa  201  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 		 158 aa  200  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  62.5 
 
 		 158 aa  199  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 158 aa  197  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  60.78 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  65.13 
 
 		 158 aa  197  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 159 aa  197  6e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  61.84 
 
 		 158 aa  197  6e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  63.4 
 
 		 159 aa  194  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 159 aa  193  6e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  62.09 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  58.82 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 		 158 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  58.44 
 
 		 166 aa  192  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  191  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  58.82 
 
 		 153 aa  191  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  190  6e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  57.79 
 
 		 166 aa  189  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  190  8e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  57.79 
 
 		 166 aa  189  8e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  63.82 
 
 		 158 aa  189  9e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  58.82 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  60.78 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  60.78 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  63.16 
 
 		 171 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  64.71 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  60.78 
 
 		 158 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  64.71 
 
 		 156 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  56.49 
 
 		 168 aa  187  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  65.36 
 
 		 156 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  61.18 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  60.78 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  57.52 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  57.52 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  63.16 
 
 		 152 aa  187  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  57.52 
 
 		 158 aa  187  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  58.82 
 
 		 158 aa  186  8e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  58.82 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  60.78 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  58.82 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  60.78 
 
 		 157 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 160 aa  184  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  58.82 
 
 		 176 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 156 aa  183  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 		 157 aa  183  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 		 203 aa  183  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  58.17 
 
 		 158 aa  183  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  57.52 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  58.55 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  58.82 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  58.82 
 
 		 173 aa  181  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 157 aa  180  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  57.52 
 
 		 160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2619  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  56.21 
 
 		 158 aa  180  6e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 168 aa  180  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  59.87 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  56.86 
 
 		 158 aa  180  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  61.44 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  60.53 
 
 		 156 aa  179  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  56.86 
 
 		 157 aa  178  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  59.21 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  56.58 
 
 		 152 aa  178  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  56.86 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>