More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0439 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  317  6e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  81.65 
 
 		 158 aa  274  4e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  81.01 
 
 		 158 aa  266  5.9999999999999995e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  60.51 
 
 		 157 aa  183  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  60.93 
 
 		 152 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 174 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 157 aa  172  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 157 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 158 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  58.94 
 
 		 152 aa  167  4e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 157 aa  164  5e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 203 aa  163  9e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 157 aa  162  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 		 164 aa  162  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 157 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  156  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  55.13 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 158 aa  153  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  52.98 
 
 		 152 aa  153  8e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 179 aa  153  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0589  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00434692  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 172 aa  153  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 158 aa  153  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 157 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 171 aa  151  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  54.72 
 
 		 173 aa  150  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  54.04 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 166 aa  150  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 156 aa  150  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 166 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  52.17 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  54.37 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  51.27 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  53.02 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 156 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  50.63 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  50.96 
 
 		 159 aa  147  8e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  51.88 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  55.92 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0163  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000328888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  51.9 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  52.63 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  50.32 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 176 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  51.9 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>