More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0669 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  168  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 157 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 203 aa  161  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 156 aa  161  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 158 aa  160  5.0000000000000005e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 157 aa  159  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 160 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 168 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 159 aa  153  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  48.75 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 174 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 168 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  150  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 165 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 156 aa  150  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 179 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 154 aa  150  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 152 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  47.47 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  46.5 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 159 aa  147  6e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  46.75 
 
 		 173 aa  147  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 152 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  46.5 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  48.73 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>