More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_31810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 172 aa  348  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  80.12 
 
 		 162 aa  265  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  69.75 
 
 		 163 aa  241  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  70.99 
 
 		 164 aa  229  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  69.14 
 
 		 164 aa  225  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  70.37 
 
 		 164 aa  225  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  69.14 
 
 		 164 aa  221  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  67.28 
 
 		 164 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  67.28 
 
 		 164 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  67.28 
 
 		 164 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  68.52 
 
 		 164 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  61.82 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  59.76 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  58.18 
 
 		 165 aa  192  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 160 aa  188  2.9999999999999997e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  56.71 
 
 		 165 aa  187  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  56.1 
 
 		 166 aa  187  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  57.58 
 
 		 164 aa  184  4e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  55.15 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  56.36 
 
 		 164 aa  180  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 167 aa  177  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 166 aa  177  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  57.23 
 
 		 160 aa  177  9e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  54.6 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  53.12 
 
 		 161 aa  167  8e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 		 163 aa  167  8e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  55.76 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  53.01 
 
 		 167 aa  167  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  53.16 
 
 		 161 aa  160  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  52.17 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  52.8 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  51.85 
 
 		 160 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  51.52 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  50.6 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  50 
 
 		 164 aa  142  2e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  46.25 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  46.25 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  46.25 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  48.05 
 
 		 160 aa  121  5e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  46.88 
 
 		 155 aa  119  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  42.48 
 
 		 162 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  42.59 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  56.86 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  45.1 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  41.57 
 
 		 159 aa  106  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  40.43 
 
 		 154 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  33.12 
 
 		 162 aa  81.6  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  34.59 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  34.59 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  36.25 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  33.79 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  33.96 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  35.17 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  34.18 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  33.11 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  35.21 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  32.28 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  33.79 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  33.79 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  33.79 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  34.27 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  33.99 
 
 		 157 aa  72  0.000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  33.79 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  33.79 
 
 		 158 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  34.21 
 
 		 160 aa  72  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  34.27 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  33.8 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  33.79 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  34.27 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  36.57 
 
 		 157 aa  71.2  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 159 aa  71.2  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  33.8 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>