More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0824 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 161 aa  327  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  85.62 
 
 		 160 aa  281  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  60.65 
 
 		 166 aa  193  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  63.46 
 
 		 164 aa  186  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  60.65 
 
 		 167 aa  186  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  58.71 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 166 aa  184  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 167 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  59.62 
 
 		 164 aa  181  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  61.15 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  55.9 
 
 		 162 aa  173  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 162 aa  168  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  54.6 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  55.21 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  53.12 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  54.72 
 
 		 160 aa  165  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  58.49 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 165 aa  164  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 167 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  54.04 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  53.42 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  53.42 
 
 		 164 aa  161  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  54.09 
 
 		 161 aa  160  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  53.37 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 160 aa  154  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  53.16 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 167 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  50.64 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  45.91 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  46.71 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  44.23 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  38.06 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 161 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 176 aa  89  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 154 aa  89  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  43.15 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 161 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 156 aa  84.7  5e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  31.87 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 156 aa  84  9e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 157 aa  84  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  32.88 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  36.55 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 162 aa  82.8  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  34.01 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  36.49 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  32.88 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  35.37 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  33.12 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  37.24 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  33.12 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  33.12 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  32.43 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  32.65 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  34.01 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  32.28 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  34.59 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  35.33 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  34.81 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  34.04 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  33.97 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  39.13 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  34.03 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  32.19 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  35.86 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  38.78 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0714  GreA/GreB family elongation factor  35.82 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000638599  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>