More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0668 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  311  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  45.28 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.59 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  37.82 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  42.14 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  39.35 
 
 		 159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 158 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  40.51 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  40.51 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 161 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  40.51 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  39.74 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 173 aa  104  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 203 aa  104  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 171 aa  103  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  103  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 161 aa  103  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 161 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  41.51 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  37.74 
 
 		 176 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 157 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  41.51 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  41.29 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 168 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  35.76 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 157 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  39.61 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 154 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  40.26 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>