More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2181 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 154 aa  304  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  52.67 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  52 
 
 		 156 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  52.67 
 
 		 159 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  50.67 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  52 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  50.66 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 175 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 175 aa  142  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  48 
 
 		 163 aa  141  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  50.35 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  48.03 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 159 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  45.7 
 
 		 159 aa  134  4e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  50.35 
 
 		 156 aa  134  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  49.33 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 155 aa  130  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 157 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  48.48 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  50.35 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 156 aa  124  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.33 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  50.67 
 
 		 164 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  44.9 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4723  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4722  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293567 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0768  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  42.67 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4588  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  41.72 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0710  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0264242 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  40.27 
 
 		 158 aa  116  9e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 159 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 156 aa  115  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf206  transcription elongation factor  40.71 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 159 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  41.96 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  39.6 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 158 aa  113  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  40.82 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 164 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  44.36 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>