More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11098 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  88.41 
 
 		 164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  88.41 
 
 		 164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  88.41 
 
 		 164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  88.34 
 
 		 164 aa  302  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  85.89 
 
 		 164 aa  296  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  84.15 
 
 		 164 aa  290  5e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  84.66 
 
 		 164 aa  288  3e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  70.73 
 
 		 162 aa  233  7e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  69.14 
 
 		 172 aa  225  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  62.96 
 
 		 163 aa  212  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  58.97 
 
 		 165 aa  187  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  57.5 
 
 		 160 aa  177  7e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  53.66 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  55.28 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.6 
 
 		 161 aa  168  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  54.27 
 
 		 162 aa  168  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  53.7 
 
 		 164 aa  167  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  53.61 
 
 		 166 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 167 aa  159  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  50 
 
 		 166 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  53.21 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 163 aa  148  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  49.7 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  49.08 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  49.09 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  47.56 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  47.27 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  47.59 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  47.83 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  44.44 
 
 		 155 aa  110  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  42.59 
 
 		 159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  38.32 
 
 		 162 aa  107  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  42.59 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  42.59 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  42.59 
 
 		 153 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  41.1 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  41.4 
 
 		 160 aa  98.2  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  38.04 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  38.89 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 154 aa  85.1  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  37.93 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  36.99 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  35.48 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  34.16 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3402  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000615218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 153 aa  79  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  35.22 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  40.3 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  33.96 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  34.23 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  33.96 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  33.56 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  36.99 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  37.67 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  34.46 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  33.96 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>