More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0768 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  100 
 
 		 159 aa  317  3e-86  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  72.33 
 
 		 159 aa  234  4e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  54.14 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  51.9 
 
 		 160 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  52.32 
 
 		 161 aa  156  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  50.33 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  50.31 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  45.03 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  48.12 
 
 		 166 aa  130  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  45.16 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  46.54 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  44.72 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 164 aa  120  8e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  44.3 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 165 aa  112  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  44.38 
 
 		 163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  41.57 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  42.94 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 164 aa  102  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  40.49 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  40.49 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  40.49 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  40.85 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  39.05 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  39.88 
 
 		 164 aa  97.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  38.04 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  39.6 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.66 
 
 		 164 aa  86.3  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  39.26 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  39.13 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  39.13 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  39.13 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  39.13 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  37.25 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  37.27 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 176 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  37.8 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  37.27 
 
 		 175 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  36.97 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  34.81 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  38.19 
 
 		 161 aa  80.9  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 159 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  40.41 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  38.93 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  38.78 
 
 		 160 aa  78.6  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  39.31 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  37.04 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  35.85 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  39.58 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  38.93 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  33.8 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  36.48 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 160 aa  75.9  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  40.82 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  36.55 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  37.33 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>