More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3096 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 167 aa  337  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  74.7 
 
 		 166 aa  269  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  71.69 
 
 		 166 aa  250  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  71.52 
 
 		 167 aa  248  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  70.3 
 
 		 166 aa  246  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  67.48 
 
 		 162 aa  230  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  61.88 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  61.54 
 
 		 160 aa  198  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  59.64 
 
 		 164 aa  198  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 160 aa  197  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  59.76 
 
 		 172 aa  194  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  59.76 
 
 		 164 aa  193  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  61.39 
 
 		 160 aa  183  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  59.12 
 
 		 160 aa  182  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  53.89 
 
 		 167 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  57.93 
 
 		 160 aa  177  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  58.75 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  56.71 
 
 		 161 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  57.86 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  56.88 
 
 		 164 aa  169  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  53.89 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  52.1 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 164 aa  157  9e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  51.57 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  51.55 
 
 		 164 aa  155  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  51.23 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  50.3 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  49.1 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  48.5 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  45.86 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  46.41 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  46.5 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.45 
 
 		 154 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 160 aa  95.5  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 153 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 157 aa  95.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  40.43 
 
 		 154 aa  94.4  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  38.96 
 
 		 162 aa  94.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 156 aa  93.6  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 157 aa  93.2  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  37.16 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 156 aa  91.7  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  38.62 
 
 		 155 aa  91.7  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 157 aa  91.3  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  39.46 
 
 		 156 aa  91.3  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  44.33 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 155 aa  89.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 161 aa  88.6  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  45.16 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  36.88 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 156 aa  88.2  5e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  36.55 
 
 		 159 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 161 aa  87.8  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  40.28 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 160 aa  87  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  36.11 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  36.43 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  36.17 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  35.46 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  34.19 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  37.82 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 157 aa  85.1  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 159 aa  85.1  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  35.57 
 
 		 157 aa  84.7  6e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  35.81 
 
 		 161 aa  84.3  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  37.75 
 
 		 156 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  34.04 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  32.62 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  35.92 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>