More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0115 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 159 aa  305  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  57.05 
 
 		 160 aa  187  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  57.96 
 
 		 163 aa  187  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  58.44 
 
 		 158 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  58.49 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  59.09 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  57.14 
 
 		 156 aa  171  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  58.33 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  57.05 
 
 		 159 aa  157  8e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  59.48 
 
 		 164 aa  155  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  48.61 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 162 aa  140  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 155 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 156 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  42.5 
 
 		 162 aa  130  9e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  45 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  44.16 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 157 aa  123  9e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  38.99 
 
 		 159 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  44.16 
 
 		 157 aa  120  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  43.24 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  41.83 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  42 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 156 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  41.33 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 158 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  40.88 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0008  transcription elongation factor GreA  43.48 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 156 aa  110  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  40.6 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  37.75 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 176 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>