More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1076 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  68.15 
 
 		 164 aa  224  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  70.97 
 
 		 160 aa  220  8e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  68.42 
 
 		 164 aa  217  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  67.74 
 
 		 161 aa  213  8e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  67.3 
 
 		 166 aa  211  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  64.33 
 
 		 160 aa  206  7e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  65.61 
 
 		 160 aa  204  4e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  62.89 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  64.15 
 
 		 167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 167 aa  197  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  62.89 
 
 		 166 aa  196  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  61.64 
 
 		 166 aa  194  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 164 aa  193  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 		 163 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 172 aa  188  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  62.8 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  59.24 
 
 		 160 aa  184  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  61.01 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  58.28 
 
 		 167 aa  179  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  57.42 
 
 		 162 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  56.05 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 165 aa  167  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  57.86 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  56.05 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 161 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 164 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 164 aa  160  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  55.41 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  54.66 
 
 		 167 aa  156  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  52.6 
 
 		 159 aa  153  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 		 167 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  46.71 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  45.81 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  40.91 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  40.91 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  40.91 
 
 		 153 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  43.57 
 
 		 154 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  46.94 
 
 		 157 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  45.92 
 
 		 159 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 159 aa  84  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  46.81 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  37.86 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  40.85 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  34.39 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  37.34 
 
 		 157 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  39.58 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  40.88 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  40.88 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  34.29 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 175 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  34.67 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 156 aa  77  0.0000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 161 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 160 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  38.3 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 157 aa  77  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  35.17 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  42.34 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  37.5 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  34.84 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  36.08 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  36.84 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  38.57 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  33.93 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>