More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1676 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  70.25 
 
 		 157 aa  214  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  66.24 
 
 		 157 aa  212  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  68.35 
 
 		 157 aa  209  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 159 aa  146  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  49.03 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 175 aa  140  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 175 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 175 aa  139  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 175 aa  138  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  48.41 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  45.45 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  47.68 
 
 		 161 aa  130  6e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 156 aa  128  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  48 
 
 		 155 aa  126  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  43.84 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 154 aa  124  7e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  45.83 
 
 		 161 aa  120  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  43.4 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  41.14 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 154 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 159 aa  113  8.999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 156 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0008  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  41.18 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 156 aa  100  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  40.71 
 
 		 160 aa  99.4  2e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  37.84 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  36.6 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  97.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 157 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 160 aa  97.4  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 156 aa  96.3  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  37.66 
 
 		 157 aa  96.7  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 172 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  39.74 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0668  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.168252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  40.14 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  39.44 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  34.62 
 
 		 158 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  34.67 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  39.49 
 
 		 160 aa  92.8  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  92.8  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 159 aa  93.2  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  38.41 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  37.75 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>