More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0130 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 163 aa  322  2e-87  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  68.99 
 
 		 158 aa  221  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  68.39 
 
 		 160 aa  216  8.999999999999998e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  67.31 
 
 		 158 aa  213  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  70.13 
 
 		 156 aa  207  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 157 aa  198  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  66.46 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  65.16 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  59.35 
 
 		 159 aa  191  5e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  57.96 
 
 		 159 aa  187  5e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 161 aa  172  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  50.99 
 
 		 162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  49.06 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  49.03 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  48 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  46.98 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  49.35 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  44.65 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 164 aa  125  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 156 aa  122  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  48.95 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  41.33 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 157 aa  120  9e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  42.54 
 
 		 160 aa  117  6e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  47.22 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  39.35 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  39.33 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 158 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  38.36 
 
 		 173 aa  114  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  40 
 
 		 158 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 168 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  47.22 
 
 		 155 aa  112  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 266 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0008  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 159 aa  111  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 157 aa  110  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 157 aa  110  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 179 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 157 aa  110  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_002936  DET0770  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.134897  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>