More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1612 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  88.12 
 
 		 160 aa  279  1e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  62.58 
 
 		 156 aa  201  5e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  58.75 
 
 		 160 aa  192  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 175 aa  186  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  62.34 
 
 		 158 aa  183  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 158 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  60.51 
 
 		 160 aa  181  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 158 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  61.69 
 
 		 175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  58.44 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  57.14 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  52.08 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 161 aa  141  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  55.48 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  45 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  48.03 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  47.68 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  44.14 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  47.71 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  47.92 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  47.68 
 
 		 172 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 176 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  46.41 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  47.41 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  50.38 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 166 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 168 aa  124  7e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 161 aa  122  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  47.37 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>