More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2089 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  53.95 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  51.61 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  51.92 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 158 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  51.92 
 
 		 158 aa  160  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  53.85 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  50.66 
 
 		 168 aa  157  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  47.74 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 158 aa  157  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 166 aa  157  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 158 aa  157  8e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 173 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 166 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  48.68 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 168 aa  154  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 176 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  47.44 
 
 		 158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  49.03 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  49.03 
 
 		 156 aa  151  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 171 aa  150  5e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  150  7e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 162 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 157 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 169 aa  148  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  49.35 
 
 		 157 aa  148  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 159 aa  147  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  48.08 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2619  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.243499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 157 aa  146  9e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 163 aa  144  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 168 aa  143  7.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 158 aa  143  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 203 aa  141  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 161 aa  140  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 152 aa  140  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  49.65 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  46.1 
 
 		 235 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>