More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0733 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  304  4.0000000000000004e-82  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 		 158 aa  210  5.999999999999999e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  66.03 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  63.46 
 
 		 157 aa  201  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 		 158 aa  184  5e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  59.62 
 
 		 157 aa  180  7e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  57.69 
 
 		 157 aa  175  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  56.13 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  53.59 
 
 		 156 aa  170  7.999999999999999e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 		 159 aa  166  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 162 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 160 aa  127  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  47.62 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  45.7 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.24 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 172 aa  124  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  43.05 
 
 		 158 aa  124  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  122  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  46.62 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  45.95 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  45.95 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 161 aa  120  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  44.16 
 
 		 159 aa  120  5e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 152 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 175 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  43.92 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  41.22 
 
 		 162 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  40.4 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  49.32 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 175 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  42.57 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  47.76 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  42.38 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 168 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  40.54 
 
 		 235 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 156 aa  113  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 157 aa  113  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>