More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0383 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 160 aa  316  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  81.13 
 
 		 163 aa  265  2e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2512  GreA/GreB family elongation factor  72.61 
 
 		 235 aa  244  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000128593  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  73.58 
 
 		 162 aa  241  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  70.44 
 
 		 161 aa  237  5.999999999999999e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  70.25 
 
 		 162 aa  229  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 158 aa  164  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  160  7e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  53.5 
 
 		 158 aa  158  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 164 aa  157  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  157  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2033  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.709774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 158 aa  154  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  52.87 
 
 		 158 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  50.96 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  48.1 
 
 		 158 aa  152  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 166 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  52.23 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 173 aa  150  8e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  150  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  51.61 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 168 aa  149  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  147  9e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 157 aa  146  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  51.63 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 203 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2727  GreA/GreB family elongation factor  51.61 
 
 		 160 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.148274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2089  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.176469  normal  0.347146 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 171 aa  143  8.000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  45.22 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 157 aa  143  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 157 aa  142  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  48.41 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>