More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1648 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  69.87 
 
 		 158 aa  217  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  66.46 
 
 		 163 aa  216  1e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  65.82 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  67.95 
 
 		 156 aa  207  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  65.19 
 
 		 160 aa  205  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  68.35 
 
 		 158 aa  200  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 		 158 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 159 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 157 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  57.05 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 		 161 aa  170  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 		 164 aa  162  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  52.32 
 
 		 162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  55.86 
 
 		 161 aa  160  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 175 aa  154  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 175 aa  154  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  50.65 
 
 		 175 aa  151  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 175 aa  148  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 159 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 156 aa  148  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  46.79 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  48.67 
 
 		 154 aa  144  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 164 aa  140  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 162 aa  137  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 156 aa  131  5e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  48.39 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  41.72 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 156 aa  127  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 160 aa  124  5e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 157 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 155 aa  124  8.000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  45.33 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 154 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  47.3 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 157 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0008  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0696  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 266 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.31866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 163 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 157 aa  117  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 166 aa  117  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>