More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0472 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 160 aa  320  4e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  63.12 
 
 		 162 aa  214  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 158 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 158 aa  195  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 158 aa  195  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 158 aa  195  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 175 aa  194  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 		 158 aa  193  9e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 		 158 aa  193  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  61.39 
 
 		 175 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 156 aa  191  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 175 aa  190  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 158 aa  187  4e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  62.16 
 
 		 159 aa  184  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  61.49 
 
 		 158 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  56.13 
 
 		 160 aa  175  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  60.51 
 
 		 160 aa  170  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 158 aa  163  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  52.94 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  47.5 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  47.5 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  47.02 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 161 aa  134  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  43.04 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  47.22 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  45 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  49.32 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 161 aa  127  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  46.81 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  46.81 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  46.81 
 
 		 166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  43.84 
 
 		 155 aa  124  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  46.62 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  48.63 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  46.81 
 
 		 168 aa  123  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 158 aa  121  5e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.79 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  47.52 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  46.21 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  42.14 
 
 		 164 aa  120  9e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 203 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  44.83 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  44.74 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 157 aa  118  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 157 aa  117  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  45 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  43.26 
 
 		 154 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 159 aa  117  7e-26  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  44.68 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>