More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0660 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  308  2e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  63.23 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  63.64 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  63.64 
 
 		 158 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 175 aa  189  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 158 aa  189  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 		 158 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  62.58 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  60.65 
 
 		 158 aa  185  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  59.74 
 
 		 175 aa  183  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  58.94 
 
 		 160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 162 aa  179  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  61.94 
 
 		 158 aa  165  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 158 aa  164  5e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  52.26 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 159 aa  148  4e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 161 aa  144  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 162 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  53.1 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  53.1 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  47.4 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  47.74 
 
 		 157 aa  141  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  140  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  50.67 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 163 aa  138  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  48.39 
 
 		 168 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  49.32 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  47.1 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 166 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  47.4 
 
 		 158 aa  133  9e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  49.01 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  51.03 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  48.03 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 157 aa  130  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  46.62 
 
 		 159 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 157 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 173 aa  130  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 161 aa  130  9e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 156 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  47.71 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 168 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  45.89 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>