More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3557 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 160 aa  309  9e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  55.7 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 158 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 159 aa  167  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 157 aa  166  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  47.47 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 156 aa  143  9e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  48.73 
 
 		 162 aa  141  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  46.25 
 
 		 160 aa  134  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 175 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  43.12 
 
 		 160 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 175 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 175 aa  122  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  40.99 
 
 		 162 aa  122  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  40.88 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  44.44 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 175 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  48.94 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  41.77 
 
 		 157 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 156 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  41.29 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  48.57 
 
 		 156 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  51.94 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  43.94 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf206  transcription elongation factor  41.29 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  38.71 
 
 		 158 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  43.75 
 
 		 160 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 163 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  41.1 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  39.35 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 157 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  36.71 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 171 aa  107  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  41.51 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  40.4 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 158 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>