More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_0208 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 158 aa  306  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  71.97 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 		 158 aa  215  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  68.35 
 
 		 160 aa  213  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  65.82 
 
 		 158 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  67.31 
 
 		 158 aa  211  3.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  68.39 
 
 		 157 aa  210  7e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  68.15 
 
 		 156 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 158 aa  208  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  65.16 
 
 		 163 aa  205  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  68.35 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  60.39 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0116  transcription elongation factor GreA  69.93 
 
 		 164 aa  184  3e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000184686  hitchhiker  0.00194606 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  58.33 
 
 		 159 aa  181  2.0000000000000003e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  57.62 
 
 		 162 aa  170  5.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  59.03 
 
 		 161 aa  163  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  54.19 
 
 		 158 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 175 aa  159  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  54.14 
 
 		 158 aa  159  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  51.28 
 
 		 175 aa  157  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 157 aa  153  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 157 aa  152  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  50.96 
 
 		 160 aa  150  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 160 aa  143  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 155 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 157 aa  141  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  50.63 
 
 		 157 aa  140  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 160 aa  140  9e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  54.42 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  48.63 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  54.84 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  51.61 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 157 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 156 aa  124  5e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  49.32 
 
 		 157 aa  124  6e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 160 aa  124  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  44 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 158 aa  121  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 160 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  120  6e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  43.14 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  43.33 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 154 aa  117  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  41.33 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 157 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>