More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0289 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 160 aa  314  3e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  88.12 
 
 		 160 aa  261  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  63.23 
 
 		 156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  58.6 
 
 		 160 aa  186  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  178  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  58.6 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 175 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  177  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 175 aa  177  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 175 aa  177  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  58.71 
 
 		 158 aa  176  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 		 158 aa  174  7e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  56.49 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  55.19 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 162 aa  151  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  45.57 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  52.56 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  48.28 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  52.14 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  47.47 
 
 		 159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  46.45 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  46.05 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 157 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 157 aa  125  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  42.31 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 169 aa  124  7e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 157 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 153 aa  122  3e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  46.41 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 161 aa  120  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 157 aa  120  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  45.07 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 162 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  45.1 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  44.9 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  48.59 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  46.26 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  43.62 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 172 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>