More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1246 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 162 aa  330  5e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  63.12 
 
 		 160 aa  214  2.9999999999999998e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 158 aa  190  7e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 158 aa  188  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 		 158 aa  187  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  57.59 
 
 		 175 aa  181  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  53.55 
 
 		 156 aa  179  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  58.22 
 
 		 158 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  60.84 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  56.85 
 
 		 159 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  52.53 
 
 		 158 aa  166  9e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  49.04 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1667  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1701  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  150  8.999999999999999e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1174  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 158 aa  149  2e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  47.5 
 
 		 160 aa  147  6e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 161 aa  143  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  46.88 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  47.13 
 
 		 158 aa  140  8e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  47.55 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  52.45 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  46.85 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 163 aa  130  6e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  46.43 
 
 		 157 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  42.5 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  46.04 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 152 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  43.61 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  40.41 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  44.6 
 
 		 168 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 156 aa  120  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  43.88 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  43.17 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  43.17 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  47.92 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  43.17 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  43.88 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  40.99 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  39.86 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  43.88 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  41.84 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  42.96 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  43.66 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  45.21 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 156 aa  114  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  41.33 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  42.45 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  40.79 
 
 		 171 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 161 aa  113  8.999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 160 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  43.48 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  40.52 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  41.01 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 168 aa  112  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  42.45 
 
 		 157 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  41.55 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  40.29 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  40.29 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  41.03 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  41.01 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  43.57 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 162 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  40.85 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 158 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>