More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_01495 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  100 
 
 		 158 aa  317  3e-86  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  70.7 
 
 		 157 aa  234  4e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  70.89 
 
 		 158 aa  233  8e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 		 160 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  61.78 
 
 		 157 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  60.51 
 
 		 157 aa  191  3e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  56.41 
 
 		 158 aa  176  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  56.13 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  53.64 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  52.63 
 
 		 159 aa  167  8e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  49.36 
 
 		 172 aa  147  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  53.29 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  50.34 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  48.99 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2612  transcription elongation factor GreA  48.99 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.657313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  48.98 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  49.32 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  49.32 
 
 		 158 aa  140  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1469  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2389  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.643877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1146  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2174  transcription elongation factor GreA  49.66 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  47.65 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2677  GreA/GreB family elongation factor  44.3 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  48.99 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4930  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.41417 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  47.65 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1263  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 168 aa  136  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260201 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2192  transcription elongation factor GreA  48.32 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127913  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  46.98 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  44.3 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2821  transcription elongation factor GreA  46.31 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  46.62 
 
 		 152 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  44.3 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4722  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293567 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4588  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4723  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  45.64 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  44.23 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  45.64 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2007  GreA/GreB family elongation factor  44.3 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  44.23 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  42.95 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>