More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1688 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 156 aa  307  2.9999999999999997e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  58.55 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  55.26 
 
 		 157 aa  177  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  57.89 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  56.58 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0304  transcription elongation factor GreA  56.58 
 
 		 157 aa  174  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  54.3 
 
 		 158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  53.59 
 
 		 157 aa  170  7.999999999999999e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  53.64 
 
 		 159 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01495  putative transcription elongation factor  53.64 
 
 		 158 aa  168  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  46 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  43.87 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  42.67 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0255  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000533555  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1240  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1733  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.669906  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  46.36 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  47.95 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  47.95 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1369  transcription elongation factor  44.67 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0830842  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  47.95 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  44.97 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  45.27 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  47.95 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  45.7 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  47.95 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  47.95 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  47.95 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  47.95 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  47.26 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  46 
 
 		 158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  48.61 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  45.33 
 
 		 158 aa  126  9.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  44.67 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  43.05 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  47.26 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  45.21 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  46.67 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  44.22 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 169 aa  125  3e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  42 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  42.28 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  42.67 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 161 aa  123  8.000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  43.33 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>