More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1535 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 160 aa  315  1e-85  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  51.3 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  49.01 
 
 		 160 aa  133  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  49.01 
 
 		 166 aa  133  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  48.75 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  47.68 
 
 		 166 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 167 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  48.05 
 
 		 172 aa  121  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 160 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  44.81 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  44.81 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  44.16 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 164 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  45.77 
 
 		 157 aa  104  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 164 aa  103  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  43.59 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  42.59 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  43.59 
 
 		 165 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  40.71 
 
 		 155 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  43.87 
 
 		 165 aa  99  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  34.42 
 
 		 162 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 156 aa  95.5  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  39.31 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 164 aa  95.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  41.67 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  40.28 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 161 aa  94  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  42.25 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  40.54 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  39.01 
 
 		 157 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 158 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0130  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 163 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.000000000129551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  41.55 
 
 		 160 aa  87.4  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0250  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000127535  normal  0.353375 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  39.01 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  40.56 
 
 		 157 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  39.61 
 
 		 159 aa  85.5  3e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  37.06 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3557  transcription elongation factor GreA  40.94 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000103558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0208  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000182043  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  37.25 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  37.24 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  37.67 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  36.17 
 
 		 152 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  36.13 
 
 		 157 aa  82  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  32.21 
 
 		 156 aa  81.6  0.000000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  37.24 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0115  GreA/GreB family elongation factor  33.99 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000137367  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 162 aa  81.3  0.000000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  38.13 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  37.01 
 
 		 161 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0640  transcription elongation factor GreA  31.61 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.104464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  39.58 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  32.21 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  32.21 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  35.03 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  33.12 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  32.21 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  32.21 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  32.67 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1648  transcription elongation factor GreA  38.93 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  32.21 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  33.99 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>