More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0940 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 167 aa  337  2.9999999999999998e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 		 167 aa  217  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  66.67 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  66.05 
 
 		 165 aa  205  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  60.78 
 
 		 162 aa  197  5e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 172 aa  187  7e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 164 aa  184  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  58.86 
 
 		 160 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 164 aa  181  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 163 aa  180  8.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  56.33 
 
 		 164 aa  179  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  58.86 
 
 		 161 aa  177  8e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 164 aa  174  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 164 aa  174  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  57.14 
 
 		 164 aa  170  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 164 aa  170  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  56.49 
 
 		 164 aa  168  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  56.13 
 
 		 165 aa  166  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  54.55 
 
 		 166 aa  164  5e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  52.76 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  53.9 
 
 		 160 aa  159  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 167 aa  159  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  54.55 
 
 		 160 aa  156  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  53.25 
 
 		 166 aa  155  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  49.69 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 167 aa  151  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  52.2 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  54.32 
 
 		 164 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  52.6 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  52.6 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  51.25 
 
 		 163 aa  146  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  49.08 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  50.97 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  48.15 
 
 		 164 aa  137  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  44.65 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  47.1 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  40.26 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  39.16 
 
 		 157 aa  89  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  39.22 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  40.91 
 
 		 155 aa  87.4  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  37.18 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  37.18 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 160 aa  80.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  37.18 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  35.71 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  34.84 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  33.11 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  38.36 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  34.44 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  36.42 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  35.48 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  39.73 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  34.97 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  34.27 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  32.26 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  34.27 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  32.68 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  30.07 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 157 aa  70.5  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  36.73 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  32.26 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0251  transcription elongation factor GreA  34.04 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0440626  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  32.88 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  34.72 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  29.94 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  29.94 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  36.3 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03407  transcription elongation factor GreA  33.97 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  33.33 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  30.99 
 
 		 155 aa  67.8  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  35.44 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  34.03 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  32.65 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  33.56 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  31.97 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0162  transcription elongation factor GreA  37.06 
 
 		 156 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  7.34558e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>