54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3597 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  58.28 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  58.28 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  58.28 
 
 		 153 aa  175  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  52.03 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  52.29 
 
 		 159 aa  143  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  46.88 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  46.91 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  46.91 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  46.91 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  46.91 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  45.68 
 
 		 164 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  45.06 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  45.06 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  45.62 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  44.44 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  42.42 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  46.05 
 
 		 162 aa  115  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  44.1 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 162 aa  107  6e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 165 aa  103  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  41.25 
 
 		 164 aa  99.4  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 165 aa  96.7  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  38.75 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  37.5 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  40.65 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 167 aa  94  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  35.95 
 
 		 166 aa  94  7e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  40.37 
 
 		 160 aa  93.6  9e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  40.91 
 
 		 160 aa  92.8  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  41.56 
 
 		 167 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 164 aa  92  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 166 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  34.38 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 167 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  38.36 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  33.12 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  33.99 
 
 		 167 aa  84  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  37.27 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  31.85 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  34.76 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  44.23 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  36.02 
 
 		 165 aa  70.5  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  33.33 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  30.82 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  31.91 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08470  nucleoside diphosphate kinase regulator  30.43 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  34.38 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  34.74 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 157 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  26.71 
 
 		 159 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2241  GreA/GreB family elongation factor  28.08 
 
 		 158 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0424752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  30.13 
 
 		 157 aa  40.4  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>