More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23090 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 163 aa  329  9e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  65.62 
 
 		 164 aa  212  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  65.38 
 
 		 164 aa  208  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  63.12 
 
 		 164 aa  205  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  62.35 
 
 		 161 aa  204  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  63.12 
 
 		 160 aa  200  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  65.58 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  62.75 
 
 		 160 aa  193  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  64.1 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  59.49 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  62.09 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  61.39 
 
 		 166 aa  185  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  60 
 
 		 167 aa  185  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  56.79 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  56.77 
 
 		 166 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  56.77 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  55.77 
 
 		 164 aa  171  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  57.42 
 
 		 160 aa  170  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  55.49 
 
 		 165 aa  170  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  58.06 
 
 		 172 aa  167  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.49 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 164 aa  153  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 164 aa  153  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  55.26 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  52.83 
 
 		 164 aa  153  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  50.94 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 164 aa  146  9e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  52.9 
 
 		 162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  51.88 
 
 		 167 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 164 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  49.68 
 
 		 164 aa  141  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  49.37 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  53.5 
 
 		 165 aa  140  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  51.25 
 
 		 167 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  47.06 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  45.22 
 
 		 160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  42.95 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  46.15 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  46.15 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  46.15 
 
 		 153 aa  104  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  42.07 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 155 aa  95.5  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  40.43 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  37.65 
 
 		 162 aa  90.9  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  40.65 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  39.72 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  39.04 
 
 		 176 aa  84  8e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 156 aa  84  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1688  transcription elongation factor GreA  32.87 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1117  transcription elongation factor GreA  36.49 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.789381  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 157 aa  81.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  38.31 
 
 		 164 aa  79.7  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  36.99 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  34.03 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  33.12 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  38.51 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  38.93 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  35.71 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  34.42 
 
 		 159 aa  78.6  0.00000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  33.54 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  36.31 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  36.24 
 
 		 157 aa  77.4  0.00000000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 159 aa  77  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  35.06 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  34.67 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  33.99 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1590  transcription elongation factor GreA  34.16 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  35.62 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>