More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0923 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 165 aa  338  2e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  96.36 
 
 		 165 aa  328  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  71.34 
 
 		 167 aa  231  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  64.33 
 
 		 163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  62.03 
 
 		 164 aa  197  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  65.43 
 
 		 167 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 164 aa  193  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  60.76 
 
 		 164 aa  192  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  61.54 
 
 		 164 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  61.29 
 
 		 162 aa  190  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  60.26 
 
 		 164 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  60.9 
 
 		 164 aa  188  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  56.71 
 
 		 172 aa  187  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  54.55 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  53.89 
 
 		 164 aa  165  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  53.29 
 
 		 166 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  54.43 
 
 		 160 aa  155  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  53.8 
 
 		 162 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  52.8 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  53.16 
 
 		 166 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  53.42 
 
 		 160 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  52.38 
 
 		 165 aa  152  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  50.6 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  53.5 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  51.9 
 
 		 167 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  51.59 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  51.9 
 
 		 161 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  48.5 
 
 		 166 aa  144  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  48.5 
 
 		 167 aa  143  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  49.39 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 164 aa  143  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  49.69 
 
 		 164 aa  139  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  53.21 
 
 		 163 aa  137  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  46.54 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  42.95 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  43.87 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  43.23 
 
 		 155 aa  97.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  39.61 
 
 		 162 aa  87  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  40.38 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  40.38 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  40.38 
 
 		 153 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  36.25 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  38.61 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  38.85 
 
 		 160 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  39.73 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  36.36 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  36.54 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  31.71 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  34 
 
 		 160 aa  74.3  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  35.21 
 
 		 160 aa  73.9  0.0000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  32.65 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  34.72 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  34.06 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  37.32 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  31.79 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  36.23 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  35.26 
 
 		 163 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  34.51 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  32.87 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  30.13 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  33.1 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  34.78 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  35.25 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  35.21 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  35.22 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  33.78 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  36.5 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  34.21 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  32.89 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  34.81 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  34.57 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>