More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1577 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 161 aa  328  2e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  88.12 
 
 		 162 aa  296  1e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  73.29 
 
 		 161 aa  258  3e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  71.88 
 
 		 162 aa  250  7e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 		 161 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  67.72 
 
 		 161 aa  222  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  67.09 
 
 		 161 aa  221  3e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  62.66 
 
 		 161 aa  214  5e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  59.12 
 
 		 167 aa  192  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 165 aa  187  7e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 171 aa  164  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  50.66 
 
 		 156 aa  163  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  52.63 
 
 		 156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  50.66 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  50.66 
 
 		 156 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  51.32 
 
 		 156 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  51.32 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 152 aa  158  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 157 aa  157  6e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  52.29 
 
 		 158 aa  157  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  51.63 
 
 		 158 aa  156  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 157 aa  155  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  50.98 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  50 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 157 aa  154  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 157 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 157 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 157 aa  150  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  50.33 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  49.34 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  48.68 
 
 		 166 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  48.7 
 
 		 158 aa  149  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  50.32 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  47.77 
 
 		 169 aa  149  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  148  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  48.67 
 
 		 164 aa  148  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  46.15 
 
 		 158 aa  147  5e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  47.06 
 
 		 158 aa  147  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  147  7e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  48.05 
 
 		 158 aa  147  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 157 aa  146  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  46.75 
 
 		 159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  49.35 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  48.08 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  48.34 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 159 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 162 aa  145  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  45.51 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0997  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 158 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00368773  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 154 aa  144  7.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  48.03 
 
 		 152 aa  143  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  45.39 
 
 		 160 aa  143  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  47.71 
 
 		 176 aa  143  9e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  48.37 
 
 		 158 aa  142  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1776  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0106174 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1429  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>