More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0201 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  60.13 
 
 		 162 aa  200  7e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  59.75 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  58.23 
 
 		 162 aa  194  6e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  59.12 
 
 		 161 aa  192  2e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  55.97 
 
 		 161 aa  191  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  55.35 
 
 		 161 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 161 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  54.09 
 
 		 161 aa  186  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 165 aa  176  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 158 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  47.33 
 
 		 164 aa  147  9e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 152 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2229  transcription elongation factor GreA  48.72 
 
 		 158 aa  143  9e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.570575  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  46.1 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 166 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  45.91 
 
 		 159 aa  141  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  45.81 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  44.03 
 
 		 168 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  44.52 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  44.23 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  47.44 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2780  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.115654  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  47.1 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  45.03 
 
 		 152 aa  136  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  43.23 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1258  transcription elongation factor GreA  43.51 
 
 		 176 aa  134  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0546  GreA/GreB family elongation factor  43.95 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 157 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0480  GreA/GreB family elongation factor  45.75 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0337518  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  41.94 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  42.58 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  42.21 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  42.04 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  41.67 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  44.16 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2571  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000433551  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  42.31 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  44.87 
 
 		 160 aa  130  6e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  45.28 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  45.28 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>