More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0546 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0546  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 174 aa  353  5.999999999999999e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  46.79 
 
 		 165 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 161 aa  136  2e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 167 aa  134  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  45.16 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  41.14 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1611  transcription elongation factor GreA  40.13 
 
 		 158 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.69568e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  41.18 
 
 		 171 aa  118  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  40.38 
 
 		 158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3981  transcription elongation factor GreB  38.16 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0171  transcription elongation factor GreB  38.16 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 156 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0520  transcription elongation factor GreB  37.5 
 
 		 187 aa  110  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.525146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 158 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  34.57 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  40.67 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  37.66 
 
 		 161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  37.66 
 
 		 158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1775  transcription elongation factor GreA  39.87 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000308338  normal  0.0541245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1753  GreA/GreB family elongation factor  38.16 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.322411 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 156 aa  108  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 158 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1901  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00416559  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4500  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  39.47 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4190  transcription elongation factor GreA  37.91 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.164972  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  39.1 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1370  transcription elongation factor GreB  38.56 
 
 		 184 aa  105  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4966  transcription elongation factor GreB  39.86 
 
 		 160 aa  105  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 156 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1494  transcription elongation factor GreB  40.14 
 
 		 158 aa  105  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 166 aa  104  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1871  transcription elongation factor GreB  38.46 
 
 		 213 aa  104  7e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  38.16 
 
 		 166 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0584  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.125264  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 157 aa  104  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0773  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.568342  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0567  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1284  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.177076  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1611  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1478  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0496142  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1508  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.150081  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2307  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 157 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0768  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.0969826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4435  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  35.53 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00620  transcription elongation factor  39.87 
 
 		 161 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1182  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2866  transcription elongation factor GreA  37.25 
 
 		 158 aa  103  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0891965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  36.08 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3737  transcription elongation factor GreB  37.5 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1170  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 163 aa  101  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1264  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.165873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0780  GreA/GreB family elongation factor  37.42 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000129967  hitchhiker  0.000100122 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0812  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  33.99 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  37.18 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1293  transcription elongation factor GreA  38.56 
 
 		 158 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>