More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1534 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1534  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 165 aa  335  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  56.96 
 
 		 162 aa  199  9.999999999999999e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  55.97 
 
 		 161 aa  194  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1310  transcription elongation factor GreA  55.06 
 
 		 162 aa  189  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.324095  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  53.46 
 
 		 161 aa  187  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  53.09 
 
 		 161 aa  186  9e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  52.47 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  51.23 
 
 		 161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1372  transcription elongation factor GreA  54.32 
 
 		 161 aa  180  8.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0201  transcription elongation factor GreA  50.31 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000273731  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  46.84 
 
 		 171 aa  153  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  45.86 
 
 		 156 aa  150  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1980  transcription elongation factor GreA  48.1 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00819368 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1774  transcription elongation factor GreA  46.54 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.110279  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  48.1 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  46.5 
 
 		 156 aa  144  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  49.02 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  44.08 
 
 		 157 aa  144  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0808  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.350185  normal  0.0132742 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  45.91 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  49.67 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  45.91 
 
 		 166 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  45.91 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1000  transcription elongation factor GreA  47.17 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.302487  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0910  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1813  transcription elongation factor GreA  43.79 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00359574  normal  0.0174151 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0480  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000270875  normal  0.813705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 157 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0394  transcription elongation factor GreA  41.83 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.715679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  43.31 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3355  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00153993  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0546  GreA/GreB family elongation factor  46.79 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2073  transcription elongation factor GreA  45.45 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.383099 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  45.28 
 
 		 158 aa  138  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03046  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000255742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0526  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3666  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000219579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0519  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000161642  hitchhiker  0.00372154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3373  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.81015e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4503  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3589  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000874781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02997  hypothetical protein  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000216901  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00085  transcription elongation factor GreA  44.74 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3477  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000110708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0453  transcription elongation factor GreA  41.83 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2213  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 158 aa  137  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  47.06 
 
 		 160 aa  137  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 157 aa  137  8.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  44.37 
 
 		 152 aa  137  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3030  transcription elongation factor GreA  43.71 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.953757  decreased coverage  0.00490744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  43.42 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3474  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  47.37 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  46.41 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3457  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0563  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00266162  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3357  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.970031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  45.22 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  44.81 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3615  transcription elongation factor GreA  45.57 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000143014  normal  0.24531 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2523  transcription elongation factor GreA  46.05 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182345  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  42.76 
 
 		 158 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  42.11 
 
 		 152 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  41.4 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2221  transcription elongation factor GreA  44 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3084  GreA/GreB family elongation factor  46.2 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2078  transcription elongation factor GreA  46.71 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000287405  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002600  transcription elongation factor GreA  46.2 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000901215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  45.1 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  41.45 
 
 		 203 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1851  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.888423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1865  transcription elongation factor GreA  43.95 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182493  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3558  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0635889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3595  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.303006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3489  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0192346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4421  transcription elongation factor GreA  42.68 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3488  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000067905  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3657  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00121074  normal  0.243551 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0798  transcription elongation factor GreA  42.86 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000258876  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  44.94 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  43.14 
 
 		 157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  42.41 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1277  transcription elongation factor GreA  44.59 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3605  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000032178  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3739  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.215382  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2027  transcription elongation factor GreA  45.75 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3982  transcription elongation factor GreA  43.67 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  40.76 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>