73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4879 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  100 
 
 		 162 aa  315  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  47.65 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  47.65 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  47.65 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  42.48 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  41.32 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  41.32 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  41.32 
 
 		 164 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  41.25 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  46.05 
 
 		 155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  40.12 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  40.12 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  38.32 
 
 		 164 aa  107  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  40.12 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  37.72 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  39.75 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  38.96 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  41.06 
 
 		 159 aa  94  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  38.99 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  39.87 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  37.65 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  40.26 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  39.24 
 
 		 162 aa  90.1  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  35.9 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  35.98 
 
 		 164 aa  89.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  34.5 
 
 		 166 aa  88.6  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  36.02 
 
 		 164 aa  88.6  4e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  37.65 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  35.71 
 
 		 166 aa  87.4  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  39.61 
 
 		 165 aa  87  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  35.8 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  34.36 
 
 		 166 aa  85.9  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  36.08 
 
 		 160 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  39.22 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  35.67 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  37.27 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  33.74 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  34.59 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  34.59 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  33.74 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  33.12 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  30.06 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  38.32 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2241  GreA/GreB family elongation factor  31.51 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0424752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1676  transcription elongation factor GreA  32.76 
 
 		 155 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000127836  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  27.81 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2487  transcription elongation factor GreA  26.9 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2897  transcription elongation factor GreA  26.62 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  29.14 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  28.97 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  29.41 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  28.29 
 
 		 156 aa  47.8  0.00006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  27.97 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  29.49 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  31.72 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  27.59 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  28.77 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  30.2 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2468  transcription elongation factor GreA  27.78 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2782  transcription elongation factor GreA  27.78 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  26.83 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  29.86 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  27.56 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0158  transcription elongation factor GreA  27.4 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  27.56 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0395  transcription elongation factor GreA  26.53 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  28.17 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08470  nucleoside diphosphate kinase regulator  27.66 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0658  transcription elongation factor GreA  26.28 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211465  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  27.46 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>