More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  77.5 
 
 		 160 aa  259  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  72.5 
 
 		 160 aa  241  3e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  74.68 
 
 		 161 aa  231  4.0000000000000004e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  70.97 
 
 		 160 aa  220  8e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  66.88 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  67.76 
 
 		 164 aa  206  8e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  62.73 
 
 		 164 aa  200  8e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  60.25 
 
 		 166 aa  187  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  60.51 
 
 		 159 aa  186  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  62.09 
 
 		 163 aa  185  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  57.23 
 
 		 165 aa  183  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  57.14 
 
 		 164 aa  178  2e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  56.69 
 
 		 162 aa  178  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  57.93 
 
 		 167 aa  177  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  59.01 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  59.49 
 
 		 166 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  57.23 
 
 		 164 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  58.02 
 
 		 166 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  56.71 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  54.14 
 
 		 159 aa  168  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  57.32 
 
 		 163 aa  164  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  54.14 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  51.85 
 
 		 172 aa  154  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  52.8 
 
 		 165 aa  153  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  53.42 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  51.55 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  50.64 
 
 		 161 aa  147  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  52.2 
 
 		 167 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  48.48 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  48.47 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  47.56 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  48.47 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  48.47 
 
 		 164 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  48.5 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  45.18 
 
 		 164 aa  134  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  47.24 
 
 		 164 aa  133  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  44.85 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  42.25 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2239  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.000000131275  normal  0.39945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1672  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.112053  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1054  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 157 aa  84.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1854  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 159 aa  83.6  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.866249  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1781  transcription elongation factor GreA  37.67 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1466  transcription elongation factor GreA  36.81 
 
 		 176 aa  82.8  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0366416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  38.31 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  38.31 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  38.31 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  39.33 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0700  transcription elongation factor GreA  37.93 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0169393  normal  0.415235 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0495  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 160 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.588124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  34.78 
 
 		 157 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  35.93 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1100  transcription elongation factor GreA  37.2 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.648513  normal  0.266643 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  38.99 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  40.26 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  37.01 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2677  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2549  transcription elongation factor GreA  38.73 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0733  hypothetical protein  35.37 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  37.27 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4815  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0909183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00740  transcription elongation factor GreA  36.99 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000778945  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  38.03 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  34.75 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1631  transcription elongation factor GreA  34.48 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0576288  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2238  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0176047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42920  transcription elongation factor GreA  41.61 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.393679  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1680  transcription elongation factor GreA  36.36 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1564  transcription elongation factor GreA  34.46 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000290434  hitchhiker  0.000735134 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  32.65 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3810  transcription elongation factor GreA  34.87 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.138968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13240  transcription elongation factor GreA  33.33 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00714364  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  38.46 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  37.59 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  32.41 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  38.04 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  36.65 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  38.89 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  32.3 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1188  transcription elongation factor GreA  35.86 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00439545  normal  0.0602948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0906  transcription elongation factor GreA  32.43 
 
 		 160 aa  72  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4226  transcription elongation factor GreA  35.19 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0978  transcription elongation factor GreA  37.5 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.389185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  31.94 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5475  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.670951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62900  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  37.76 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  37.42 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  36.65 
 
 		 160 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  36.11 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>