More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4418 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4418  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 163 aa  332  1e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31810  transcription elongation factor GreA  69.75 
 
 		 172 aa  241  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.58029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0707  transcription elongation factor GreA  67.7 
 
 		 162 aa  228  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.927788  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1636  transcription elongation factor GreA  64.63 
 
 		 164 aa  218  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2048  transcription elongation factor GreA  62.8 
 
 		 164 aa  213  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.148142  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3148  transcription elongation factor GreA  64.2 
 
 		 164 aa  213  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0838733  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11098  transcription elongation factor GreA  62.96 
 
 		 164 aa  212  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000759427  normal  0.450066 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4668  transcription elongation factor GreA  61.59 
 
 		 164 aa  210  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.741319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4144  transcription elongation factor GreA  61.73 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0426558  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4375  transcription elongation factor GreA  61.73 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.366203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4219  transcription elongation factor GreA  61.73 
 
 		 164 aa  209  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0866  transcription elongation factor GreA  63.06 
 
 		 165 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0610793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0923  transcription elongation factor GreA  64.33 
 
 		 165 aa  197  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.212607  normal  0.453288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0726  transcription elongation factor GreA  62.18 
 
 		 167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1076  transcription elongation factor GreA  62.8 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1887  transcription elongation factor GreA  59.12 
 
 		 162 aa  181  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.559588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0094  GreA/GreB family elongation factor  61.25 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.351516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3096  transcription elongation factor GreA  58.75 
 
 		 167 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.289834 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0940  transcription elongation factor GreA  61.04 
 
 		 167 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1239  transcription elongation factor GreA  57.32 
 
 		 164 aa  170  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1064  transcription elongation factor GreA  57.86 
 
 		 166 aa  169  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8535  GreA/GreB family elongation factor  56.6 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3904  GreA/GreB family elongation factor  57.23 
 
 		 160 aa  168  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0764375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1167  GreA/GreB family elongation factor  56.69 
 
 		 164 aa  167  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.440534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0668  transcription elongation factor GreA  57.41 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0940  GreA/GreB family elongation factor  57.76 
 
 		 161 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08210  transcription elongation factor  57.32 
 
 		 160 aa  164  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.029534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0980  transcription elongation factor GreA  54.6 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2635  GreA/GreB family elongation factor  57.93 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0447  transcription elongation factor GreA  55.35 
 
 		 167 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1893  transcription elongation factor GreA  56.1 
 
 		 160 aa  160  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0824  transcription elongation factor GreA  54.78 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.364949  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23090  transcription elongation factor GreA  54.43 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1099  transcription elongation factor GreA  53.33 
 
 		 165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0225388  normal  0.455968 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05080  transcription elongation factor GreA  51.27 
 
 		 164 aa  143  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.543117  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07260  transcription elongation factor  51.25 
 
 		 164 aa  143  9e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.548379 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1535  GreA/GreB family elongation factor  48.72 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0571  prokaryotic transcription elongation factor, GreA/GreB, N-terminal domain protein  45.16 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0436205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0768  transcription elongation factor  44.38 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1945  GreA/GreB family elongation factor  52.34 
 
 		 157 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817259 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4879  GreA/GreB family elongation factor  39.75 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.36597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3597  GreA/GreB family elongation factor  44.1 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0995544  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4781  GreA/GreB family elongation factor  39.13 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.830945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5616  GreA/GreB family elongation factor  40.37 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0146939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5236  GreA/GreB family elongation factor  40.37 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5324  GreA/GreB family elongation factor  40.37 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.316809 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4821  transcription elongation factor GreA  38.03 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  36.36 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0327  transcription elongation factor GreA  34.18 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  33.57 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0313  transcription elongation factor GreA  38.1 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4033  transcription elongation factor GreA  36.55 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000315443  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0335  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1684  transcription elongation factor GreA  37.41 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2329  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl102  transcription elongation factor GreA  35.29 
 
 		 156 aa  72  0.000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0627  transcription elongation factor GreA  33.11 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0951  GreA/GreB family elongation factor  36.3 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000196364  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  34.51 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  33.55 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1191  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 158 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  34.64 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2847  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000241028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1013  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.267207  normal  0.0365336 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1078  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.949733  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1017  transcription elongation factor GreA  34.93 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.250708  hitchhiker  0.00044331 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1653  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186205  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0813  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000426484  normal  0.0245884 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1784  transcription elongation factor GreA  30.57 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.867694  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1115  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.179374  hitchhiker  0.000000000961411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3252  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0358868  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2837  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0107078  normal  0.0269415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1444  transcription elongation factor GreA  36.05 
 
 		 161 aa  68.9  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00276226  normal  0.0904446 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3430  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.910726  hitchhiker  0.000543609 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3294  transcription elongation factor GreA  34.25 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00887513  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0383  transcription elongation factor GreA  35.17 
 
 		 160 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0620714 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  33.1 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0977  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  33.1 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  34.51 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3574  transcription elongation factor GreA  34.42 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.601656  hitchhiker  0.00344058 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  31.91 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0828  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0209829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0880  GreA/GreB family elongation factor  33.78 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  33.1 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0832  transcription elongation factor GreA  35.42 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000149804  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  32.69 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  33.76 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  34.39 
 
 		 175 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>