More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1784 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1784  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 165 aa  337  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.867694  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0183  transcription elongation factor GreA  60.93 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.346208  hitchhiker  0.0000567891 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1515  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 174 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6800  transcription elongation factor GreA  42.38 
 
 		 158 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.817091 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1456  transcription elongation factor GreA  41.72 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2181  transcription elongation factor GreA  38.41 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.015275  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4606  transcription elongation factor GreA  41.06 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127343  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0654  transcription elongation factor GreA  36.6 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.156211  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0289  transcription elongation factor GreA  40.91 
 
 		 160 aa  103  8e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0520  transcription elongation factor GreB  36 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.525146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1155  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 156 aa  101  5e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3836  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 158 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.722398 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2450  transcription elongation factor GreA  40.4 
 
 		 158 aa  101  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.596907 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1044  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 162 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000369398  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0972  transcription elongation factor GreA  40.27 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1389  transcription elongation factor  38.26 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  3.76815e-17  hitchhiker  8.922560000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1218  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1089  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1612  transcription elongation factor GreA  38.17 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.986319  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1023  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0151  GreA/GreB family elongation factor  37.58 
 
 		 160 aa  99.8  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000044733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2481  transcription elongation factor GreA  39.6 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0133  transcription elongation factor GreA  36.77 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.431567  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0426  transcription elongation factor GreA  36.49 
 
 		 156 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.194189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0008  transcription elongation factor GreA  36 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000636821  hitchhiker  0.00000229317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3127  transcription elongation factor GreA  38.26 
 
 		 158 aa  99  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.59991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2876  transcription elongation factor GreA  39.74 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1214  transcription elongation factor GreA  40 
 
 		 158 aa  98.6  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000531032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2887  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1660  transcription elongation factor GreA  39.07 
 
 		 157 aa  97.8  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.985567  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1377  transcription elongation factor GreA  34.23 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2118  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0984  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 157 aa  97.4  8e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.406423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1254  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.378894  normal  0.504509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6110  transcription elongation factor GreB  33.73 
 
 		 173 aa  96.7  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0850  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.209846 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2715  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2976  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.174839  normal  0.133661 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1454  transcription elongation factor GreA  37.75 
 
 		 203 aa  95.9  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.267598  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4207  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.388023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1242  transcription elongation factor GreA  37.09 
 
 		 164 aa  96.3  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000024894  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0809  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 157 aa  95.9  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000158219  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1504  transcription elongation factor GreA  37.75 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.893814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1128  transcription elongation factor GreA  38.22 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1017  transcription elongation factor GreA  38 
 
 		 158 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0868  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.639151  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1246  transcription elongation factor GreA  35.33 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0270341  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3748  transcription elongation factor GreA  33.78 
 
 		 156 aa  94.4  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4293  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0077  transcription elongation factor GreA  35.33 
 
 		 157 aa  94  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00207801  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3017  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 157 aa  94  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3619  transcription elongation factor GreA  38.67 
 
 		 158 aa  94  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0986  transcription elongation factor GreA  35.44 
 
 		 158 aa  94  9e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2353  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000000957781  decreased coverage  0.00150302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2312  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 152 aa  93.6  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.693473  hitchhiker  0.00295599 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4461  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.310238  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1129  GreA/GreB family elongation factor  36.67 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4512  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1577  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2751  transcription elongation factor GreA  36.91 
 
 		 168 aa  92.8  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0660  transcription elongation factor GreA  36.67 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.143981  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1002  transcription elongation factor GreA  36.54 
 
 		 156 aa  92  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0423  transcription elongation factor GreA  35.14 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1776  transcription elongation factor GreA  35.14 
 
 		 156 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2209  transcription elongation factor GreA  36.96 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1728  transcription elongation factor GreA  36.96 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4459  transcription elongation factor GreA  34.9 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0719149 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02242  Transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0681866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4499  transcription elongation factor GreA  36.24 
 
 		 175 aa  92  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.251038  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2119  transcription elongation factor GreA  36.96 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.736032  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3092  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4275  transcription elongation factor GreA  34.9 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.282937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4112  transcription elongation factor GreA  34.9 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4123  transcription elongation factor GreA  34.9 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0940  transcription elongation factor GreA  35.33 
 
 		 172 aa  91.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4607  transcription elongation factor GreA  34.9 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1561  transcription elongation factor GreA  36.18 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.970872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0566  transcription elongation factor GreA  37.33 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0510993  normal  0.103581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0439  transcription elongation factor GreA  34.18 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1370  transcription elongation factor GreB  33.77 
 
 		 184 aa  91.7  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2474  transcription elongation factor GreA  34.46 
 
 		 156 aa  91.7  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0737  transcription elongation factor GreA  35.57 
 
 		 175 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.718576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0673  transcription elongation factor GreA  36.42 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.487901 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0144  transcription elongation factor GreA  32.45 
 
 		 163 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0498  transcription elongation factor GreA  34.46 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0472  transcription elongation factor GreA  38.82 
 
 		 160 aa  91.7  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.384084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1522  transcription elongation factor GreA  35.1 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0731  GreA/GreB family elongation factor  33.78 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000249638 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0174  transcription elongation factor GreA  36.84 
 
 		 158 aa  91.3  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000153177  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2139  transcription elongation factor GreA  35.62 
 
 		 157 aa  91.3  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.194554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3076  transcription elongation factor GreA  33.78 
 
 		 171 aa  90.9  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1725  transcription elongation factor GreA  35.76 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3400  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0549133  normal  0.0891208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1629  transcription elongation factor GreA  31.13 
 
 		 162 aa  90.5  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.95572  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19500  transcription elongation factor GreA  35.95 
 
 		 155 aa  90.1  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000496817  unclonable  0.000000000539704 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0669  transcription elongation factor GreA  33.77 
 
 		 159 aa  90.1  1e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0788  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0638  transcription elongation factor GreA  37.58 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2561  transcription elongation factor GreB  35.33 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.01679  hitchhiker  0.00000000000012211 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0875  transcription elongation factor GreA  34 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.73287  normal  0.0631013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>